281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2982 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  57.68 
 
 
305 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  57.68 
 
 
305 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  57.68 
 
 
305 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  55.85 
 
 
308 aa  326  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  54.95 
 
 
309 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  52.67 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  53.72 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  53.74 
 
 
317 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  53.74 
 
 
317 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  53.06 
 
 
314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  52.72 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  52.72 
 
 
317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  54.01 
 
 
317 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  51.23 
 
 
309 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  51.06 
 
 
316 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  50.17 
 
 
300 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  50.51 
 
 
301 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  52.94 
 
 
295 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  51.03 
 
 
316 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  50.18 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  48.83 
 
 
300 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  51.6 
 
 
301 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  50.87 
 
 
310 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  51.08 
 
 
306 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  50 
 
 
301 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  47.68 
 
 
316 aa  275  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  45.28 
 
 
319 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  48.08 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  45.36 
 
 
303 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  46.94 
 
 
305 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  46.5 
 
 
381 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.27 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  47.1 
 
 
304 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  44.55 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  43 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  44.56 
 
 
298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  45.12 
 
 
318 aa  237  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  43.81 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  44.21 
 
 
297 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  44.53 
 
 
312 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  44.07 
 
 
293 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  41.67 
 
 
309 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  40.91 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  40.86 
 
 
322 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  40.36 
 
 
306 aa  185  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  37.17 
 
 
315 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  37.7 
 
 
315 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  37.38 
 
 
315 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  38.8 
 
 
315 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  36.22 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  38.33 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  35.58 
 
 
315 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  36.16 
 
 
315 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.12 
 
 
321 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  36.65 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  36.93 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  36.65 
 
 
292 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  36.43 
 
 
277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  36.3 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  34.63 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  36.3 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  36.3 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  36.3 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  36.3 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  35.94 
 
 
292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  35.23 
 
 
282 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  35.23 
 
 
282 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  35.23 
 
 
282 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  35.53 
 
 
267 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  34.66 
 
 
280 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  34.33 
 
 
303 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  35 
 
 
277 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  39.01 
 
 
277 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  39.07 
 
 
335 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  38.71 
 
 
277 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  35.87 
 
 
264 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  35.57 
 
 
323 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  33.82 
 
 
307 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  35.27 
 
 
264 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  38.35 
 
 
277 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  34.52 
 
 
278 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  34.06 
 
 
282 aa  155  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  33.21 
 
 
283 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  35.02 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  34.66 
 
 
277 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  34.3 
 
 
277 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  32.86 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  32.86 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  32.86 
 
 
283 aa  152  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  32.86 
 
 
283 aa  152  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  32.86 
 
 
283 aa  152  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  32.86 
 
 
283 aa  152  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  32.86 
 
 
283 aa  152  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  34.86 
 
 
282 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  37.59 
 
 
281 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  32.86 
 
 
283 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  34.86 
 
 
282 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  33.8 
 
 
306 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  34.66 
 
 
291 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>