More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0989 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  69.96 
 
 		 467 aa  636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  100 
 
 		 467 aa  931    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  74.46 
 
 		 467 aa  655    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  69.46 
 
 		 470 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  69.03 
 
 		 470 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  69.03 
 
 		 470 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  68.87 
 
 		 495 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  68.52 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  68.02 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  66.31 
 
 		 471 aa  596  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  64.22 
 
 		 468 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  61.51 
 
 		 470 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  61.51 
 
 		 467 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  63.54 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  62.37 
 
 		 481 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  56.54 
 
 		 493 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  58.6 
 
 		 479 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.96 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  59.74 
 
 		 460 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  60.18 
 
 		 463 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  59.17 
 
 		 460 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  57.91 
 
 		 483 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  57.97 
 
 		 463 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  57.08 
 
 		 465 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  57.24 
 
 		 491 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  60.17 
 
 		 463 aa  485  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  56.16 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  54.74 
 
 		 476 aa  468  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  55.72 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  55.41 
 
 		 471 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  54.66 
 
 		 468 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  53.75 
 
 		 491 aa  455  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  55.27 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  55.98 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  54.19 
 
 		 478 aa  438  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  56.77 
 
 		 480 aa  438  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 470 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.14 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.22 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.62 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.89 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.87 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 		 616 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.3 
 
 		 562 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.93 
 
 		 468 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.47 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.47 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.3 
 
 		 470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  30 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 		 491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.26 
 
 		 465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 470 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 470 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 470 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 470 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 470 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 470 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 470 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.4 
 
 		 473 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 470 aa  213  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 470 aa  213  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 		 470 aa  213  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 		 467 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.91 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.94 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 		 459 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.22 
 
 		 459 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.54 
 
 		 463 aa  210  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.22 
 
 		 459 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.93 
 
 		 468 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.93 
 
 		 468 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 		 465 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.04 
 
 		 459 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.21 
 
 		 468 aa  209  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.37 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  30 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  30.18 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.76 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.97 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.59 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.32 
 
 		 465 aa  207  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 		 469 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.57 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.78 
 
 		 474 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.77 
 
 		 479 aa  206  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.07 
 
 		 468 aa  206  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.68 
 
 		 585 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.93 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.32 
 
 		 466 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.4 
 
 		 469 aa  205  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.57 
 
 		 466 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  29.76 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 		 484 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.91 
 
 		 462 aa  203  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3831  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  32.39 
 
 		 476 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.3 
 
 		 492 aa  203  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.01 
 
 		 462 aa  203  7e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>