More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3467 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  51.4 
 
 
641 aa  635    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
670 aa  1316    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  50.15 
 
 
642 aa  623  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  50.46 
 
 
663 aa  598  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  44.7 
 
 
646 aa  579  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  44.7 
 
 
646 aa  581  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  44.7 
 
 
646 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  44.7 
 
 
646 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  44.7 
 
 
646 aa  579  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  44.55 
 
 
646 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  44.55 
 
 
646 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  44.55 
 
 
646 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  44.24 
 
 
646 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  44.24 
 
 
646 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  44.39 
 
 
646 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 
608 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  45.37 
 
 
668 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0166  AMP-dependent synthetase and ligase  44.65 
 
 
623 aa  498  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  40.66 
 
 
663 aa  493  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  45.45 
 
 
643 aa  494  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 
641 aa  487  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 
694 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  39.27 
 
 
670 aa  478  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  38.5 
 
 
674 aa  478  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7333  AMP-dependent synthetase and ligase  40.21 
 
 
650 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1428  AMP-dependent synthetase and ligase  42.6 
 
 
640 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922087  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6401  AMP-dependent synthetase and ligase  42.6 
 
 
640 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172099  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  41.68 
 
 
638 aa  445  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1821  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 
652 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 
608 aa  439  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0200095  normal  0.25307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  38.3 
 
 
655 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  39.37 
 
 
658 aa  427  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  41.34 
 
 
715 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  40.58 
 
 
656 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  41.52 
 
 
654 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  37.85 
 
 
650 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  38.24 
 
 
648 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  40.1 
 
 
661 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  39.18 
 
 
661 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  38.52 
 
 
639 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  39.39 
 
 
661 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  39.91 
 
 
655 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  38.37 
 
 
666 aa  412  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  39.91 
 
 
655 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  38.58 
 
 
650 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  39 
 
 
649 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6450  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 
650 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  hitchhiker  0.0000000000000110833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  38.67 
 
 
639 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  36.43 
 
 
670 aa  413  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  40.03 
 
 
674 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  39.15 
 
 
649 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4507  acetate/CoA ligase  40.13 
 
 
663 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424676  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  36.88 
 
 
660 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  39.75 
 
 
655 aa  409  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  36.99 
 
 
652 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  37.48 
 
 
667 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  39.05 
 
 
656 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  36.68 
 
 
652 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  37.34 
 
 
652 aa  404  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  38.18 
 
 
651 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  39.41 
 
 
661 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  38.28 
 
 
646 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  39.3 
 
 
651 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  35.63 
 
 
638 aa  402  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  39.97 
 
 
657 aa  405  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  38.1 
 
 
652 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  38.1 
 
 
652 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  39.43 
 
 
659 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3958  acetyl-CoA synthetase  38.1 
 
 
652 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  39.56 
 
 
653 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  36.84 
 
 
632 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  38.01 
 
 
666 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4531  acetyl-CoA synthetase  37.78 
 
 
652 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  39.94 
 
 
651 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  37.85 
 
 
670 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4621  acetyl-CoA synthetase  37.54 
 
 
652 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  36.84 
 
 
631 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  36.68 
 
 
632 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  38.1 
 
 
652 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  37.13 
 
 
666 aa  401  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4619  acetyl-CoA synthetase  37.54 
 
 
652 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.341691  normal  0.539786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  38.1 
 
 
652 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  38.65 
 
 
654 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  38.01 
 
 
660 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03901  hypothetical protein  38.1 
 
 
652 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4535  acetyl-CoA synthetase  37.54 
 
 
652 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  37.44 
 
 
668 aa  401  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  37.6 
 
 
651 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  38.46 
 
 
663 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  38.01 
 
 
660 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  38.05 
 
 
650 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  37.7 
 
 
652 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  37.99 
 
 
656 aa  398  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4528  acetyl-CoA synthetase  37.38 
 
 
652 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855103  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0053  acetyl-CoA synthetase  38.01 
 
 
645 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4701  acetyl-CoA synthetase  38.47 
 
 
644 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120403  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  39.17 
 
 
667 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  37.91 
 
 
652 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4670  acetyl-CoA synthetase  37.38 
 
 
652 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  37.05 
 
 
658 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>