More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0434 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  57.94 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  57.94 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  56.17 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  44.78 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  37.11 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  33.46 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  36.75 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  35.06 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.65 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  37.66 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  34.01 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  36.99 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  33.99 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  38.74 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  35.47 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  35.8 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  36.71 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  36.71 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  36.84 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  33.49 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  39.91 
 
 		 222 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.75 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  37.07 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  36.91 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  35.11 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  35.11 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  35.11 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  34.04 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  35.11 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  35.78 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  34.39 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  34.39 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  34.39 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  34.3 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  33.6 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  34.39 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  33.6 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  33.6 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  34.78 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  34.78 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  35.51 
 
 		 240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  36.11 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  37.5 
 
 		 254 aa  144  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  35 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  34.05 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  33.8 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  32.91 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  32.91 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  32.91 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  32.91 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  35.18 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  36.73 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  33.18 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  33.03 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  32.08 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  33.62 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  32.49 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.89 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  33.18 
 
 		 301 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  32.79 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  33.64 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  34.56 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.89 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  32.72 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  35.35 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  33.03 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  32.26 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  35.58 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  34.1 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  34.1 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  33.18 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  34.06 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  32.58 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  33.64 
 
 		 261 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  32.72 
 
 		 269 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  37.67 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  30.32 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.74 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  31.15 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  34.1 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  34.1 
 
 		 303 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  32.95 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  34.23 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>