83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0620 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
378 aa  786    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  41.19 
 
 
495 aa  275  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  40.61 
 
 
391 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  41.19 
 
 
522 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  37.91 
 
 
487 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  40.54 
 
 
507 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.04 
 
 
342 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  36.68 
 
 
518 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  39.44 
 
 
484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  37.11 
 
 
588 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  35.71 
 
 
486 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  36.32 
 
 
566 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  37.57 
 
 
551 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  35.16 
 
 
538 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  36.99 
 
 
496 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  37.8 
 
 
544 aa  223  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  36 
 
 
528 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  36.19 
 
 
541 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.51 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  28.32 
 
 
590 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  28.32 
 
 
600 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  28.99 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  31.49 
 
 
663 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  31.52 
 
 
574 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  28.23 
 
 
817 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.97 
 
 
608 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  30.27 
 
 
604 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  30.54 
 
 
632 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  26.3 
 
 
607 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.7 
 
 
392 aa  96.7  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  28.37 
 
 
600 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.14 
 
 
803 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  26.61 
 
 
597 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  25 
 
 
598 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.45 
 
 
419 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  25.43 
 
 
597 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0022  hypothetical protein  24.39 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0523508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  31.34 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 
531 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  28.18 
 
 
667 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.2 
 
 
612 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  26.34 
 
 
592 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  28.51 
 
 
509 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  30.58 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  27.67 
 
 
594 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  32.11 
 
 
502 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  28.5 
 
 
594 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  31.05 
 
 
503 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  30.1 
 
 
469 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  31.58 
 
 
512 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.85 
 
 
723 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  27.67 
 
 
588 aa  63.9  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  30.85 
 
 
472 aa  63.5  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.24 
 
 
334 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  27.4 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  24.18 
 
 
614 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.38 
 
 
580 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  24.3 
 
 
633 aa  60.1  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26.8 
 
 
428 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  26.8 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  26.29 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  26.26 
 
 
491 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  27.69 
 
 
634 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  25.85 
 
 
796 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  25.38 
 
 
491 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  28.57 
 
 
496 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.32 
 
 
784 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1067  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.7 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  26.78 
 
 
464 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.36 
 
 
421 aa  50.4  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  23.76 
 
 
441 aa  50.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.52 
 
 
885 aa  49.7  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0737  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.81 
 
 
303 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0793  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.81 
 
 
303 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  24.89 
 
 
880 aa  46.2  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  26.09 
 
 
896 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1789  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.86 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000854791  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0063  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.08 
 
 
301 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  25 
 
 
878 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.5 
 
 
284 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5803  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.79 
 
 
320 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0397535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2521  sulfate adenylyltransferase subunit 2  24.79 
 
 
320 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.42 
 
 
220 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>