More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0083 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0083  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
291 aa  594  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.293903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2672  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 
300 aa  317  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2657  enoyl-CoA hydratase  53.21 
 
 
296 aa  279  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000176785  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5972  enoyl-CoA hydratase  45.1 
 
 
337 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.629143  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5455  enoyl-CoA hydratase  43.28 
 
 
294 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1830  enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 
289 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.507342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2182  enoyl-CoA hydratase  41.51 
 
 
289 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1151  enoyl-CoA hydratase  42.54 
 
 
295 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0246  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
316 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.107145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00068  enoyl-CoA hydratase  41.03 
 
 
289 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.279285  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0401  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3463  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123163  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5278  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
292 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0460  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
290 aa  198  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5286  enoyl-CoA hydratase  39.78 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2572  enoyl-CoA hydratase  39.78 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5121  enoyl-CoA hydratase  39.41 
 
 
287 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3965  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 
287 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224001  normal  0.0275416 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3555  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 
287 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4743  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
292 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1087  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.98 
 
 
696 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2993  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.06 
 
 
696 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251416  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.85 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2522  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.18 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2897  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  39.39 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1547  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  31.36 
 
 
637 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000330184  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.82 
 
 
695 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.13 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.53 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  26.06 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7074  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  33.63 
 
 
697 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.663612  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  36.2 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1949  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.36 
 
 
692 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.08 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1524  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
706 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.979788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0322  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.59 
 
 
748 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672087  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  43.53 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.58 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02700  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.81 
 
 
719 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.52 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  43.53 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.37 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.41 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.78 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6106  short chain enoyl-CoA hydratase  40.45 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.71 
 
 
692 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0400  short chain enoyl-CoA hydratase  37.43 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0904838  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08370  short chain enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0645146  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1841  short chain enoyl-CoA hydratase  37.62 
 
 
150 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.51 
 
 
651 aa  67.4  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1432  cyclohexa-1,5-dienecarbonyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.68 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30.72 
 
 
258 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.41 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.39 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.78 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.39 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.21 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14440  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.59 
 
 
715 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.14 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1391  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  41.38 
 
 
706 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.587506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.67 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  27.69 
 
 
663 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.14 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4318  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.57 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 
797 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2595  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42.17 
 
 
706 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156058  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  31.85 
 
 
716 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0734076  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09128  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01210)  30.2 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  35.78 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3747  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  32.64 
 
 
730 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3517  fatty oxidation complex, alpha subunit  33.62 
 
 
721 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.330047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  29.85 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  30.65 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  37.61 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>