222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2389 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  57.67 
 
 		 192 aa  217  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  58.29 
 
 		 193 aa  214  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  56.19 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  56.19 
 
 		 191 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  51.6 
 
 		 184 aa  171  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  49.74 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  48.19 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  48.42 
 
 		 208 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  49.74 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  49.48 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  48.66 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  46.84 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  46.32 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  46.63 
 
 		 196 aa  151  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  43.32 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  43.32 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  43.32 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  43.32 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  42.25 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  43.85 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  41.71 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  45.55 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  40.11 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  37.97 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  41.12 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  38.42 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  34.74 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  36.32 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  33.33 
 
 		 186 aa  98.6  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  35.75 
 
 		 187 aa  98.6  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  34.21 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  32.83 
 
 		 187 aa  95.9  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  35.82 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  32.62 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  30.85 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  32.79 
 
 		 188 aa  91.3  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  32.81 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  28.8 
 
 		 184 aa  88.2  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  34.97 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  31.38 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  29.35 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  29.19 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  32.99 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  34.04 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  30.53 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  32.12 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  29.84 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  30.89 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  31.94 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  28.89 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  29.44 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  32.04 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  29.63 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  30.34 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  30.05 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  32.1 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  29.78 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  30.65 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  27.75 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  32.7 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  28.65 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  32.09 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  31.74 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  30.06 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  30.49 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  28.73 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1764  protein of unknown function DUF179  27.18 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.619647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  28.11 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  29.24 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0009  hypothetical protein  27.33 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  30.95 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  29.17 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  31.41 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  29.24 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  29.26 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  29.35 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  32.12 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  28.4 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  28.4 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  34.42 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  31.77 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  30.27 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  28.26 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  32.37 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  27.78 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  28.88 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  28.4 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  29.84 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  28.07 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  29.84 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  28.07 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  29.24 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>