More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2134 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_15990  DNA topoisomerase IV subunit B  69.57 
 
 		 710 aa  949    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.440467  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1763  DNA topoisomerase IV subunit B  69.1 
 
 		 709 aa  965    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1988  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  66.9 
 
 		 715 aa  928    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1425  DNA topoisomerase IV subunit B  66.29 
 
 		 723 aa  921    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2280  DNA gyrase subunit B domain protein  53.77 
 
 		 680 aa  703    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.557074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3307  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  82.69 
 
 		 701 aa  1204    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1611  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  77.42 
 
 		 696 aa  1050    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00143665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7084  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  74.53 
 
 		 690 aa  995    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2134  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 702 aa  1427    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2394  DNA topoisomerase  74.38 
 
 		 690 aa  999    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367142  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08220  DNA topoisomerase IV subunit B  54.85 
 
 		 701 aa  732    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1613  DNA topoisomerase IV subunit B  65.91 
 
 		 702 aa  924    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000263124 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0298  DNA topoisomerase plasmid partition protein B  53.41 
 
 		 758 aa  784    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1534  DNA topoisomerase IV subunit B  66.71 
 
 		 693 aa  900    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300498  normal  0.0102248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1680  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  55.75 
 
 		 702 aa  750    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.313615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1922  DNA topoisomerase IV subunit B  66.67 
 
 		 708 aa  881    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  0.0348119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2055  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  65.82 
 
 		 713 aa  891    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14380  DNA topoisomerase IV subunit B  64.69 
 
 		 705 aa  909    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1619  DNA topoisomerase IV subunit B  65.34 
 
 		 702 aa  921    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0681707  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13260  DNA topoisomerase IV subunit B  66.9 
 
 		 701 aa  899    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0630779  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1427  DNA topoisomerase IV subunit B  69.12 
 
 		 703 aa  918    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1674  DNA gyrase subunit B  55.6 
 
 		 730 aa  745    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.759972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2958  DNA topoisomerase IV subunit B  66.57 
 
 		 710 aa  972    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15910  DNA topoisomerase IV subunit B  65.62 
 
 		 709 aa  913    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.39843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  47.25 
 
 		 644 aa  587  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  45.51 
 
 		 640 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  48.26 
 
 		 636 aa  581  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  48.26 
 
 		 636 aa  580  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  44.35 
 
 		 675 aa  579  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  48.1 
 
 		 628 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  46.41 
 
 		 649 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  46.35 
 
 		 642 aa  569  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.74 
 
 		 633 aa  568  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  48.76 
 
 		 637 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  45.85 
 
 		 632 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  45.14 
 
 		 686 aa  558  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  45.55 
 
 		 636 aa  557  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  47.24 
 
 		 633 aa  558  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  47.28 
 
 		 651 aa  556  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  43.63 
 
 		 647 aa  555  1e-156  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  46.37 
 
 		 661 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  48.32 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  44.72 
 
 		 645 aa  549  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  46.19 
 
 		 634 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  45.93 
 
 		 656 aa  550  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  44.54 
 
 		 650 aa  547  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  42.79 
 
 		 637 aa  546  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  45.82 
 
 		 657 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.25 
 
 		 641 aa  546  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  46.33 
 
 		 635 aa  546  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  45.92 
 
 		 643 aa  543  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  45.01 
 
 		 648 aa  544  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  46.78 
 
 		 635 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  45.07 
 
 		 633 aa  545  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 		 661 aa  545  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  45.3 
 
 		 654 aa  545  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  44.49 
 
 		 665 aa  542  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  43.92 
 
 		 714 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  44.75 
 
 		 651 aa  543  1e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  48.39 
 
 		 640 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  45.86 
 
 		 640 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  46.32 
 
 		 650 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  45.47 
 
 		 641 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  46.08 
 
 		 640 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  43.81 
 
 		 642 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  46.33 
 
 		 650 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  46.08 
 
 		 640 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  43.3 
 
 		 675 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  45.16 
 
 		 648 aa  538  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  45.57 
 
 		 644 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  44.33 
 
 		 627 aa  538  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  44.56 
 
 		 637 aa  535  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  46.54 
 
 		 720 aa  537  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  44.17 
 
 		 635 aa  535  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  45.92 
 
 		 644 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  42.73 
 
 		 637 aa  533  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  44.51 
 
 		 696 aa  533  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  45.43 
 
 		 691 aa  534  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  44.03 
 
 		 642 aa  535  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  43.91 
 
 		 633 aa  534  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  41.36 
 
 		 650 aa  534  1e-150  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  43.85 
 
 		 675 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  45.07 
 
 		 636 aa  534  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  43.97 
 
 		 634 aa  533  1e-150  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  44.26 
 
 		 644 aa  534  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  43.85 
 
 		 675 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  43.85 
 
 		 675 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  46.12 
 
 		 649 aa  533  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  43.94 
 
 		 654 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  46.92 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  43.94 
 
 		 654 aa  529  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 640 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  44.01 
 
 		 660 aa  530  1e-149  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  46.16 
 
 		 649 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  44.26 
 
 		 654 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  44.74 
 
 		 644 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  43.94 
 
 		 654 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  47.21 
 
 		 640 aa  529  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  43.97 
 
 		 650 aa  531  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>