More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0628 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 93 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  87.1 
 
 		 93 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  70.97 
 
 		 98 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  75.27 
 
 		 92 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  70.21 
 
 		 99 aa  133  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  59.14 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  58.06 
 
 		 185 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 187 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 188 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  57.61 
 
 		 209 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 237 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  57.45 
 
 		 193 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  53.19 
 
 		 235 aa  100  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3296  nucleoid protein Hbs  54.26 
 
 		 202 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1903  nucleoid protein Hbs  57.45 
 
 		 225 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.388212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1923  nucleoid protein Hbs  57.45 
 
 		 225 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1969  nucleoid protein Hbs  57.45 
 
 		 225 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.843128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 232 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13001  DNA-binding protein hupB (histone-like protein)  55.32 
 
 		 214 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4225  histone family protein DNA-binding protein  55.32 
 
 		 217 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6004  histone family protein DNA-binding protein  55.91 
 
 		 285 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0576704  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4236  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2137  histone family protein DNA-binding protein  55.32 
 
 		 212 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  50 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.89 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  48.89 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  48.89 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.89 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  48.89 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  48.89 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  48.89 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  51.76 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1967  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00606172  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  43.33 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  49.47 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3512  histone-like DNA-binding protein  46.07 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.848806  normal  0.0177296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1234  histone family protein DNA-binding protein  47.67 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  50 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  44.57 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  45.56 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  44.09 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  47.83 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  47.06 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  47.37 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1480  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 222 aa  80.9  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.041939  normal  0.737338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  46.67 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  39.36 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  43.33 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  46.74 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>