More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3377 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
349 aa  711    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  63.46 
 
 
353 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  57.73 
 
 
365 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  57.73 
 
 
365 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  60.81 
 
 
350 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  60.52 
 
 
350 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  57.35 
 
 
348 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  53.98 
 
 
366 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  54.83 
 
 
341 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  56.69 
 
 
340 aa  388  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  52.83 
 
 
355 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  54.55 
 
 
341 aa  355  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  53.12 
 
 
337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  50.44 
 
 
347 aa  342  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  49.7 
 
 
337 aa  337  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  50.16 
 
 
345 aa  337  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  50.62 
 
 
337 aa  335  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  49.27 
 
 
351 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  48.54 
 
 
348 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  51.23 
 
 
372 aa  325  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  48.76 
 
 
355 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
352 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  46.73 
 
 
336 aa  322  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  50.46 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  46 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  49.39 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  46.88 
 
 
347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  48.93 
 
 
347 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  48.62 
 
 
347 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  50.16 
 
 
335 aa  316  4e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  46.13 
 
 
346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  48.45 
 
 
342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  48.78 
 
 
351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  45.91 
 
 
345 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  49.24 
 
 
349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  45.2 
 
 
353 aa  298  8e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  48.93 
 
 
347 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  44.22 
 
 
341 aa  292  6e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  43.9 
 
 
374 aa  292  7e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  44.59 
 
 
350 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  45.57 
 
 
335 aa  290  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  45.51 
 
 
333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  42.9 
 
 
351 aa  288  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  45.14 
 
 
337 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.04 
 
 
334 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  43.65 
 
 
372 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  43.44 
 
 
339 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  42.36 
 
 
334 aa  286  4e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  43.29 
 
 
374 aa  286  5e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  45.31 
 
 
349 aa  285  7e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  44.24 
 
 
332 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.75 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  45.51 
 
 
346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  45.89 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.75 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  43.61 
 
 
332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 
334 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  44.09 
 
 
334 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  41.27 
 
 
326 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  43.61 
 
 
333 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  43.3 
 
 
333 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  43.3 
 
 
333 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  43.3 
 
 
333 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  43.13 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  42.77 
 
 
336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  43.45 
 
 
333 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 
336 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.64 
 
 
336 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  40.75 
 
 
334 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  41.9 
 
 
337 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 
336 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  43.45 
 
 
336 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  39.07 
 
 
342 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  43.12 
 
 
348 aa  256  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  41.25 
 
 
338 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  41.25 
 
 
380 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
362 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  42.17 
 
 
338 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  41.56 
 
 
337 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  42.41 
 
 
349 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  40.95 
 
 
332 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  43.08 
 
 
347 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.27 
 
 
351 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.27 
 
 
351 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  42.59 
 
 
351 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 
335 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 
347 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 
347 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
338 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 
347 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.27 
 
 
351 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  42.27 
 
 
351 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.27 
 
 
351 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  41.96 
 
 
347 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.27 
 
 
351 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  42.77 
 
 
347 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  42.45 
 
 
347 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  41.84 
 
 
345 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  42.14 
 
 
347 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>