55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3048 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  100 
 
 
733 aa  1406    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  38.24 
 
 
1531 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  30.73 
 
 
2656 aa  219  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  29.45 
 
 
5166 aa  214  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  28.48 
 
 
5203 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  27.34 
 
 
5544 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  28.05 
 
 
8918 aa  144  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28 
 
 
3373 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  25.19 
 
 
5517 aa  130  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  23.18 
 
 
1243 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  25.84 
 
 
2990 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  26.57 
 
 
1665 aa  105  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  25.6 
 
 
2604 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  23.44 
 
 
2047 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  25 
 
 
1337 aa  94.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  25 
 
 
1337 aa  94.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  22.71 
 
 
2876 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  25.16 
 
 
2890 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  29.43 
 
 
733 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  28.9 
 
 
1263 aa  78.2  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  25.08 
 
 
586 aa  78.2  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  24.33 
 
 
1727 aa  75.1  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.3 
 
 
1336 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  21.89 
 
 
666 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  24.36 
 
 
2112 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  26.2 
 
 
382 aa  60.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  19.32 
 
 
1307 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  28.49 
 
 
3324 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  21.6 
 
 
1508 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  48.1 
 
 
440 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  19.31 
 
 
1328 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  27.98 
 
 
436 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  28.49 
 
 
1153 aa  57  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  28.49 
 
 
1153 aa  57  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  41.77 
 
 
436 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  41.77 
 
 
436 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  36.46 
 
 
2176 aa  54.3  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  27.98 
 
 
965 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  27.98 
 
 
965 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  37.66 
 
 
2713 aa  51.6  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.66 
 
 
502 aa  51.2  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 
1984 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  20.75 
 
 
2179 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  26.37 
 
 
870 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  22 
 
 
3210 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  18.46 
 
 
4791 aa  47.4  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  30.7 
 
 
2000 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  21.77 
 
 
3190 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  18.78 
 
 
1112 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  20.79 
 
 
3242 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  28.78 
 
 
1809 aa  45.8  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  27.04 
 
 
1314 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  25.43 
 
 
1519 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  21.14 
 
 
3486 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  21.14 
 
 
3333 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>