More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2198 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
314 aa  635    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.29 
 
 
315 aa  481  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.25 
 
 
315 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.02 
 
 
316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.66 
 
 
314 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.06 
 
 
314 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.06 
 
 
314 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  70.06 
 
 
315 aa  460  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15691  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.03 
 
 
316 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0980  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.71 
 
 
316 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0489  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.78 
 
 
317 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.22 
 
 
316 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18481  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.39 
 
 
316 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.672263 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16521  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.55 
 
 
316 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.55 
 
 
316 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.198196  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.24 
 
 
316 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16291  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.24 
 
 
316 aa  360  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04841  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.46 
 
 
316 aa  360  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  56.13 
 
 
369 aa  348  5e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  49.69 
 
 
365 aa  323  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 
287 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.22 
 
 
287 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.26 
 
 
288 aa  205  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.94 
 
 
288 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.9 
 
 
288 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.26 
 
 
287 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.26 
 
 
286 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.24 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  39.03 
 
 
287 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.45 
 
 
286 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.26 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 
286 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.56 
 
 
291 aa  195  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.31 
 
 
291 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  38.87 
 
 
309 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.56 
 
 
286 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
286 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1026  ATP synthase F1, gamma subunit  34.92 
 
 
295 aa  193  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.56 
 
 
286 aa  193  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.74 
 
 
289 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.56 
 
 
286 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.56 
 
 
286 aa  192  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
281 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.62 
 
 
287 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.24 
 
 
286 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.24 
 
 
286 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  37.24 
 
 
326 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.67 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.67 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  37.9 
 
 
287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.65 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  36.79 
 
 
304 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
289 aa  189  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  37.38 
 
 
305 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.31 
 
 
289 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.59 
 
 
287 aa  189  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.59 
 
 
287 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.59 
 
 
287 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  37.66 
 
 
286 aa  188  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0876  ATP synthase F1, gamma subunit  37.46 
 
 
294 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.92 
 
 
286 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  36.16 
 
 
293 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  35.53 
 
 
286 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  34.59 
 
 
285 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
287 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  36.05 
 
 
290 aa  186  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.13 
 
 
289 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  36.77 
 
 
286 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
290 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  39.37 
 
 
291 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.54 
 
 
298 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  35.13 
 
 
303 aa  186  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.08 
 
 
288 aa  185  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.33 
 
 
287 aa  185  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.08 
 
 
288 aa  185  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.53 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.53 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  35.24 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.39 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.29 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  34.94 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.35 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.49 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.4 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.56 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.35 
 
 
283 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 
288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.65 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.65 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>