74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2050 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2050  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  854    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.737754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  69.92 
 
 
820 aa  348  8e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  53.56 
 
 
649 aa  272  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2279  WD-40 repeat-containing protein  33.52 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  31.84 
 
 
581 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2330  hypothetical protein  32.96 
 
 
240 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  34.19 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  29.08 
 
 
539 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  32.88 
 
 
578 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  31.12 
 
 
706 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  30.29 
 
 
582 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  30.71 
 
 
706 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.18 
 
 
542 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0291  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444686  normal  0.420509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1423  WD-40 repeat-containing protein  29.05 
 
 
239 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3646  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
472 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.307006  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3046  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.55 
 
 
284 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.933946  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1552  trypsin-like serine protease, putative  29.68 
 
 
285 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159955  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0104  periplasmic serine protease DO  30.38 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1039  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.57 
 
 
280 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2898  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.01 
 
 
273 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1644  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.81 
 
 
267 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2618  GUN4-like  29.56 
 
 
623 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000189308  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  30.38 
 
 
472 aa  51.2  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1645  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.39 
 
 
264 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.773574 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2300  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  23.91 
 
 
493 aa  50.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  28.43 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  28.3 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  28.07 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  28.07 
 
 
472 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  28.07 
 
 
472 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  27.67 
 
 
465 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  25.16 
 
 
465 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  26.4 
 
 
471 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  26.63 
 
 
511 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  25.43 
 
 
494 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2049  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.81 
 
 
275 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.718333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1535  hypothetical protein  48.48 
 
 
82 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00581338  normal  0.0581996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.28 
 
 
512 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  25.7 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  28.85 
 
 
467 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.86 
 
 
507 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  25.16 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  24.18 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  25.84 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  25.77 
 
 
512 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.7 
 
 
518 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  29.88 
 
 
499 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  25.79 
 
 
372 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3287  2-alkenal reductase  25.15 
 
 
413 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3357  serine protease  25.6 
 
 
413 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000249985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3307  serine protease  25.6 
 
 
413 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0235916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3611  serine protease HtrA  25.6 
 
 
413 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83857e-25 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  24.31 
 
 
487 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  31.06 
 
 
517 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2255  hypothetical protein  25.56 
 
 
671 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00144777  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2617  GUN4-like  24.87 
 
 
600 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000986346  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3626  serine protease HtrA  25 
 
 
413 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000566135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3395  serine protease  25 
 
 
413 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3660  serine protease  25 
 
 
413 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590944  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  23.26 
 
 
476 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.57 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  25.16 
 
 
467 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.77 
 
 
524 aa  43.5  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1049  DegS serine peptidase  25.71 
 
 
348 aa  43.1  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0146114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0174  GUN4-like  26.25 
 
 
552 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1607  serine protease HtrA  25.93 
 
 
413 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000329826  hitchhiker  0.000000000234039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3708  serine protease HtrA  25.93 
 
 
413 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.38 
 
 
475 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.9 
 
 
512 aa  43.1  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.38 
 
 
475 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.38 
 
 
475 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  25.16 
 
 
467 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>