164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4597 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
187 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1940  peptidase M52, hydrogen uptake protein  56.28 
 
 
201 aa  164  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  52.66 
 
 
167 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  51.81 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  51.61 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  52.31 
 
 
169 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  46.79 
 
 
170 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2138  peptidase M52, hydrogen uptake protein  50 
 
 
137 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.577863  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2184  peptidase M52, hydrogen uptake protein  50 
 
 
137 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  41.96 
 
 
170 aa  98.2  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  34.84 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  32.68 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  36.08 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  33.53 
 
 
195 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  36.13 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  32.47 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.82 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.33 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  32.8 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  29.05 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  36.03 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  31.03 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  35.63 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  32.45 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  35.2 
 
 
206 aa  64.3  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  33.93 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0916  hydrogenase maturation protease  34.15 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.712591  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.13 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  33.56 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  37.28 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  33.33 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  25.49 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  33.51 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  32.45 
 
 
160 aa  61.6  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 
169 aa  61.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  30.54 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  31.95 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  34.42 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  30.54 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  34.46 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  33.58 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.65 
 
 
164 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  30.54 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.65 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.65 
 
 
164 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  30.54 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.65 
 
 
164 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.65 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  30.54 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  36.24 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  35.19 
 
 
168 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  33.55 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  34.78 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  30.2 
 
 
194 aa  58.9  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 
152 aa  58.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  30.86 
 
 
224 aa  58.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  32.43 
 
 
159 aa  58.2  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.13 
 
 
159 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  31.54 
 
 
160 aa  58.2  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  29.45 
 
 
164 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  28.86 
 
 
166 aa  57.8  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.45 
 
 
164 aa  57.8  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  29.45 
 
 
164 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  29.45 
 
 
164 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.45 
 
 
164 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.45 
 
 
164 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.45 
 
 
164 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.45 
 
 
164 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.45 
 
 
164 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  31.72 
 
 
207 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  30.2 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  34.42 
 
 
164 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  31.76 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  27.7 
 
 
160 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  32.1 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.5 
 
 
166 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.71 
 
 
167 aa  55.1  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  32.41 
 
 
223 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  34.9 
 
 
169 aa  54.7  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  30.54 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  31.17 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  30.41 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.82 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  29.79 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  27.03 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  30.41 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  36.42 
 
 
191 aa  52  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  30.41 
 
 
198 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  31.29 
 
 
150 aa  51.6  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 
170 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  30.41 
 
 
198 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  30.41 
 
 
198 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  30.06 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  34.11 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  27.08 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  28.08 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  36.18 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>