49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3856 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3856  protein of unknown function DUF541  100 
 
 
235 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5190  protein of unknown function DUF541  47.95 
 
 
229 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3756  hypothetical protein  46.4 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.919622  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4138  hypothetical protein  42.79 
 
 
214 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.276184  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  26.42 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  25.16 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  31.9 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  24.28 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  23.7 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  23.18 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0492  protein of unknown function DUF541  35 
 
 
225 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  25.23 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  22.22 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  27.78 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  25.14 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  27.37 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  25.79 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  25.14 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  23.39 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  25.74 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  20.21 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  23.64 
 
 
240 aa  48.9  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  23.47 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  25.26 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 
245 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6970  protein of unknown function DUF541  33.03 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  25.5 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  23.4 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  21.76 
 
 
233 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  22.8 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  25.61 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  23.68 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  21.71 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  28.98 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  24.21 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  24.06 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  22.22 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  21.05 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2733  protein of unknown function DUF541  26.7 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  21.79 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  23.08 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  20.39 
 
 
223 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  20.57 
 
 
235 aa  42  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  20.39 
 
 
219 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  21.05 
 
 
223 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  21.15 
 
 
223 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  25.11 
 
 
258 aa  41.6  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>