36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3756 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3756  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.919622  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4138  hypothetical protein  83.1 
 
 		 214 aa  333  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.276184  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5190  protein of unknown function DUF541  46.12 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3856  protein of unknown function DUF541  44.8 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  27.03 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  25.6 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  27.33 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  26.44 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  29.67 
 
 		 245 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  26.7 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  25.79 
 
 		 258 aa  48.5  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  25.15 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  25.15 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  25.15 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  28.83 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  26.95 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  23.12 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0492  protein of unknown function DUF541  36.05 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6970  protein of unknown function DUF541  32.11 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  21.53 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  28.7 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  28.05 
 
 		 281 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  27.78 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  28.24 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  28.31 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  26.78 
 
 		 250 aa  42.4  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  26.78 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  23.53 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  25.73 
 
 		 246 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  25.26 
 
 		 238 aa  42  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  27.56 
 
 		 237 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  42  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1416  protein of unknown function DUF541  28.26 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.496752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>