31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3660 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  772    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  66.67 
 
 
353 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  65.43 
 
 
350 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  58.65 
 
 
364 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  56.06 
 
 
356 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  56.06 
 
 
356 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  56.06 
 
 
356 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  54.87 
 
 
354 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  56.47 
 
 
354 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  58.94 
 
 
383 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  51.6 
 
 
363 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  53.87 
 
 
361 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  50.13 
 
 
384 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  47.16 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  50.45 
 
 
393 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  50.97 
 
 
414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  45.54 
 
 
349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  43.92 
 
 
361 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  45.57 
 
 
351 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  40.62 
 
 
344 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  37.43 
 
 
365 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  36.53 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  27.71 
 
 
602 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  25.64 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25 
 
 
644 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  27.85 
 
 
647 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1705  hypothetical protein  24.65 
 
 
706 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.410139  hitchhiker  0.00605437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  29.27 
 
 
644 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  23.35 
 
 
621 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  23.35 
 
 
621 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  21.89 
 
 
621 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>