81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2235 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  100 
 
 
227 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  54.95 
 
 
202 aa  225  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  53.03 
 
 
206 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  54.11 
 
 
209 aa  188  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  44.98 
 
 
216 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  41.38 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  39.02 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  39.07 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  36.76 
 
 
231 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  36.19 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  41.67 
 
 
224 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  34.16 
 
 
232 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  36.45 
 
 
236 aa  121  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  36.89 
 
 
222 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  37.75 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  35.03 
 
 
301 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  34.52 
 
 
304 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  33.17 
 
 
239 aa  102  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  36.21 
 
 
234 aa  101  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  33.66 
 
 
256 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  36.5 
 
 
230 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  32.99 
 
 
273 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  32.99 
 
 
273 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  32.99 
 
 
273 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  34.33 
 
 
220 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  31.53 
 
 
243 aa  98.6  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  35.44 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  32.84 
 
 
449 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  33 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  34.25 
 
 
218 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  34.5 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  34.16 
 
 
219 aa  91.7  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  33.17 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  33.5 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  31.77 
 
 
453 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  31.5 
 
 
532 aa  81.6  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  29.19 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  28.57 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  32.11 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  32.11 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  32.46 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  32.63 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  29.69 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  29.69 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  29.9 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  29.53 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  26.4 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  28.57 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  30.05 
 
 
277 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  32.31 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  26.84 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  26.84 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  24.52 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  26.19 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  27.51 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  24.74 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  43.24 
 
 
82 aa  51.6  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  29.5 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  29.5 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  29.06 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  26.42 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  29.13 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  30.41 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  30.29 
 
 
275 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  29.74 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  30.04 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  26.46 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  29.29 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  27.23 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  28.18 
 
 
338 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  27.87 
 
 
433 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  29.61 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  26.96 
 
 
327 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  28 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  25.89 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  26.96 
 
 
262 aa  43.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  25.47 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  26.29 
 
 
428 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  25.93 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22620  hypothetical protein  26.44 
 
 
253 aa  41.6  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  25.71 
 
 
269 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>