More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0619 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0619  nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 141 aa  289  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  65.44 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  65.22 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  62.5 
 
 		 144 aa  192  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  64.71 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  61.76 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  61.76 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  60.87 
 
 		 141 aa  183  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  58.82 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 139 aa  180  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2784  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2765  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2678  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  58.57 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2721  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2896  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  59.56 
 
 		 140 aa  179  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  59.42 
 
 		 143 aa  179  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  179  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  57.86 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  57.86 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 139 aa  177  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3018  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  59.56 
 
 		 164 aa  176  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  56.52 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 141 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 141 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1552  nucleoside diphosphate kinase  57.69 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.744593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  57.04 
 
 		 140 aa  167  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 147 aa  167  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 147 aa  167  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  53.62 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5149  Nucleoside-diphosphate kinase  54.41 
 
 		 139 aa  167  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  54.81 
 
 		 140 aa  166  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0387  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 		 141 aa  166  8e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  56.62 
 
 		 140 aa  166  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 		 141 aa  166  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  52.9 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>