40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3229 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 380 aa  744    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  70.24 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  69.17 
 
 		 362 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  61.05 
 
 		 367 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  62.22 
 
 		 368 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  47.43 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  43.3 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  47.11 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  47.11 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  43.13 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  40.11 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  41.21 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  42.42 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  42.08 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  40.93 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  41.01 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  37.39 
 
 		 379 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  26.8 
 
 		 652 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.91 
 
 		 1079 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  31.48 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  29.75 
 
 		 581 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  28.34 
 
 		 711 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  25.27 
 
 		 487 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.62 
 
 		 930 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  27.62 
 
 		 470 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  27.21 
 
 		 472 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 504 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 		 732 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1750 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1146 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.82 
 
 		 1163 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  22.03 
 
 		 903 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0414  NHL repeat containing protein  26.8 
 
 		 803 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316951  normal  0.387155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  26.97 
 
 		 639 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 1177 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.63 
 
 		 522 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30 
 
 		 1351 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1030 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  31.87 
 
 		 498 aa  44.3  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  27.65 
 
 		 623 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>