35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0939 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  78.41 
 
 
263 aa  424  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  60.9 
 
 
266 aa  315  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  44.32 
 
 
271 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  44.94 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  42.13 
 
 
270 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  37.74 
 
 
263 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  36.78 
 
 
270 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  37.4 
 
 
263 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  37.55 
 
 
274 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  34.75 
 
 
262 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  36.6 
 
 
268 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  30.86 
 
 
264 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  33.07 
 
 
276 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  35.25 
 
 
311 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  31 
 
 
270 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  32.82 
 
 
291 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  29.64 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  30 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  30 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  30 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  30.2 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  27.82 
 
 
299 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  28.46 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  25.88 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  27.89 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0223  thioesterase-like protein  25.89 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  27.05 
 
 
280 aa  49.7  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  25.3 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  27.05 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10534  conserved hypothetical protein  28 
 
 
343 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152696  normal  0.163322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0816  hypothetical protein  26.14 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02424  putative acyl-CoA thioesterase, TesB family protein  21.34 
 
 
271 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4024  acyl-CoA thioesterase II, putative  25 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>