227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0823 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0823  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  100 
 
 
470 aa  913    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174459  normal  0.603656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1521  TPR repeat-domain-containing protein SEL1 subfamily-like protein  57.92 
 
 
471 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  hitchhiker  0.000333519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 
599 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  28.54 
 
 
1402 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.88 
 
 
416 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  28.07 
 
 
684 aa  100  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  29.09 
 
 
1877 aa  99.4  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.65 
 
 
961 aa  97.1  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  33.7 
 
 
464 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  29.78 
 
 
489 aa  94  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  27.2 
 
 
831 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.33 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  26.86 
 
 
789 aa  91.7  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  26.64 
 
 
482 aa  90.9  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4770  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.7 
 
 
383 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.45 
 
 
557 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  27.45 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.03 
 
 
503 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  27.45 
 
 
490 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.55 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  27.95 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.36 
 
 
2413 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
976 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3726  TPR repeat-containing protein  21.38 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000157755  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.52 
 
 
305 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 
1032 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  28.75 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  29.86 
 
 
679 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.74 
 
 
528 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  28.2 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.51 
 
 
261 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1217  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.51 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  26.34 
 
 
1281 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 
842 aa  73.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  26.87 
 
 
1037 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0340  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.43 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.72 
 
 
680 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  28.02 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.64 
 
 
256 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  27.82 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.48 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.4 
 
 
838 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  27.9 
 
 
985 aa  70.1  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.21 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.24 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.06 
 
 
318 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  25.84 
 
 
380 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0344  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
298 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.71 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3565  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.65 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  25.26 
 
 
685 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 
1430 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  32.88 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  27.88 
 
 
1134 aa  67  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
255 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  25.48 
 
 
1493 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  32.49 
 
 
705 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 
416 aa  64.7  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1507  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.01 
 
 
229 aa  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.58 
 
 
450 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1290  hypothetical protein  24.45 
 
 
1602 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.450967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2590  Sel1 domain-containing protein  32.8 
 
 
401 aa  63.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  26.8 
 
 
850 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  27.41 
 
 
233 aa  62.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.18 
 
 
316 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.53 
 
 
278 aa  63.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  28.71 
 
 
331 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
303 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  28.43 
 
 
1249 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  25 
 
 
1366 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
252 aa  62  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  26.21 
 
 
1002 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.33 
 
 
341 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0342  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
298 aa  60.1  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  25.21 
 
 
331 aa  60.1  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.88 
 
 
865 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2792  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.13 
 
 
455 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2272  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.05 
 
 
363 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  32.93 
 
 
1059 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0483  Sel1 domain-containing protein  28.8 
 
 
511 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431486  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  25.57 
 
 
940 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 
1526 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  37.93 
 
 
1086 aa  58.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.29 
 
 
265 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  27.66 
 
 
235 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  28.24 
 
 
331 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.24 
 
 
331 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  29.22 
 
 
241 aa  57  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  25.38 
 
 
523 aa  57  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1438  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
517 aa  57  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.636598 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1085  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.9 
 
 
450 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  27.31 
 
 
1141 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.06 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  26.06 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.32 
 
 
282 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3857  Sel1 domain-containing protein  28.16 
 
 
511 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.277473  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  24.73 
 
 
1078 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  32.04 
 
 
978 aa  54.7  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  30.85 
 
 
399 aa  54.3  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.51 
 
 
270 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>