150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0475 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0475  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 120 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2268  anti-sigma-factor antagonist  75.65 
 
 		 126 aa  173  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2794  anti-sigma-factor antagonist  67.24 
 
 		 125 aa  153  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3743  anti-sigma-factor antagonist  66.07 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4410  anti-sigma-factor antagonist  61.86 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3134  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  57.39 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2415  anti-sigma-factor antagonist  58.26 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2971  anti-sigma-factor antagonist  56.78 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0800  anti-sigma-factor antagonist  56.64 
 
 		 123 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0977014  hitchhiker  0.00820415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0130  anti-sigma-factor antagonist  58.26 
 
 		 118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5230  anti-sigma-factor antagonist  56.14 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3767  anti-sigma-factor antagonist  56.52 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0691716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1672  negative regulator of sigma-B  56.3 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4971  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  57.26 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1493  anti-sigma-factor antagonist  56.9 
 
 		 134 aa  130  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.423658  normal  0.0757983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0511  anti-sigma-factor antagonist  56.14 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3340  anti-sigma-factor antagonist  56.14 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3136  anti-sigma-factor antagonist  52.5 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0981532  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2487  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  51.67 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  53.51 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5778  anti-sigma-factor antagonist  54.39 
 
 		 125 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1218  negative regulator of sigma-B  52.21 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0163  anti-sigma-factor antagonist  53.98 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.438455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0676  anti-sigma-factor antagonist  53.98 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.483964  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0736  anti-sigma-factor antagonist  56.64 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2683  anti-sigma-factor antagonist  49.54 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3438  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0775335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32010  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  42.98 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0737154  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0140  anti-sigma-factor antagonist  49.11 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00670241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3858  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1474  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  39.32 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000611379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0693  anti-sigma-factor antagonist  39.09 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1811  anti-sigma-factor antagonist  35.85 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6566  anti-sigma-factor antagonist  39.47 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778948  normal  0.044329 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0196  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0995683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  37.61 
 
 		 295 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 372 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  35.9 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  36.89 
 
 		 556 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  36.89 
 
 		 549 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  32.11 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  36.46 
 
 		 430 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 		 428 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  31.9 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.84 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.25 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 275 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 282 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  30.84 
 
 		 283 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 385 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 439 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 388 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 288 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.36 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 283 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 372 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 312 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 667 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.97 
 
 		 285 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 421 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 		 272 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 445 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 281 aa  50.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 357 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  29.57 
 
 		 286 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  29.51 
 
 		 377 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 365 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 291 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 366 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 284 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  38.27 
 
 		 509 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 279 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 365 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 365 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 357 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  31.86 
 
 		 377 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 361 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 292 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 411 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 271 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 286 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 523 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 308 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 359 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 287 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 292 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 291 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 288 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 298 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 261 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 559 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  31.78 
 
 		 424 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>