119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2783 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  100 
 
 
176 aa  347  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  40.59 
 
 
198 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  46.73 
 
 
177 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  33.95 
 
 
222 aa  97.8  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  31.47 
 
 
209 aa  85.1  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  35.36 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  36.32 
 
 
202 aa  77.8  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  35.34 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  31.68 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  29.7 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  32.39 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  28.26 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  25.89 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  30.84 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  29.13 
 
 
246 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  32.5 
 
 
202 aa  61.6  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  32.07 
 
 
204 aa  61.2  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  31.71 
 
 
206 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  25.11 
 
 
236 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  30.48 
 
 
208 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  35.11 
 
 
230 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  42.47 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  37.84 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  35.11 
 
 
231 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  31.28 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  30.48 
 
 
208 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  31.06 
 
 
229 aa  54.7  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  35.62 
 
 
293 aa  54.7  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  35.37 
 
 
264 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  37.84 
 
 
224 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  32.88 
 
 
199 aa  54.3  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  36.71 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  36.71 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  31.76 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  27.87 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  27.49 
 
 
214 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  36.71 
 
 
232 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  35.37 
 
 
231 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  35.37 
 
 
231 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0168  hypothetical protein  31.25 
 
 
296 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0348  Sporulation domain protein  31.25 
 
 
277 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647009  normal  0.768364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  35.44 
 
 
232 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  34.25 
 
 
248 aa  52.4  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  34.25 
 
 
248 aa  52.4  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  41.1 
 
 
289 aa  52  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  42.03 
 
 
213 aa  52  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  25.71 
 
 
198 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  32.88 
 
 
274 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  40.54 
 
 
260 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  32.17 
 
 
238 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  32.88 
 
 
265 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4367  putative cell division protein FtsN  33.33 
 
 
191 aa  51.2  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  29.25 
 
 
190 aa  51.2  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  29.7 
 
 
185 aa  50.8  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  33.78 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3328  sporulation domain-containing protein  30.83 
 
 
263 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  34.62 
 
 
352 aa  50.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  34.25 
 
 
265 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  33.78 
 
 
282 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  33.78 
 
 
282 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  33.78 
 
 
301 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  33.78 
 
 
297 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  33.78 
 
 
295 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  33.78 
 
 
297 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  33.78 
 
 
282 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  33.78 
 
 
282 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  33.78 
 
 
286 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  33.78 
 
 
286 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  33.78 
 
 
282 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  31.13 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  39.73 
 
 
342 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  33.78 
 
 
292 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  33.78 
 
 
298 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  33.78 
 
 
301 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0005  cell division protein FtsN  28.38 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  38.95 
 
 
339 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  31.94 
 
 
192 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  35.62 
 
 
211 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  34.25 
 
 
303 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  30.26 
 
 
238 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 
238 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 
238 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 
238 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 
230 aa  48.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  42.37 
 
 
337 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  34.25 
 
 
315 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  42.86 
 
 
325 aa  47.8  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  30.89 
 
 
238 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  30.26 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  38.36 
 
 
341 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 
231 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  36.84 
 
 
346 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  31.43 
 
 
231 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  31.43 
 
 
231 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0377  sporulation domain-containing protein  27.63 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  25 
 
 
188 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1811  hypothetical protein  36.92 
 
 
260 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  39.62 
 
 
335 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  35.38 
 
 
243 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1941  Sporulation domain protein  36.84 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>