More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1659 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  100 
 
 		 75 aa  148  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  45.31 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  45.31 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  43.08 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 861 aa  58.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  41.79 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  41.79 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 849 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2277  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.938593  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0206  Heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 823 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  43.28 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  43.75 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 818 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 857 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  37.1 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  45.59 
 
 		 70 aa  57  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  40.3 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  43.28 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 754 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  39.13 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 855 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  41.18 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  35.82 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  44.93 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 835 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  45.83 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 942 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  37.1 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  34.29 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 852 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  40.32 
 
 		 1196 aa  53.9  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  43.75 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 		 820 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 836 aa  52.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  40.58 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 839 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  40.58 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  35.82 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 825 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  38.46 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 833 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.27 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 976 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  40.3 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  46.81 
 
 		 794 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  41.1 
 
 		 841 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  34.92 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 		 840 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 811 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 795 aa  50.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 811 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  41.94 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 74 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  41.94 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 1071 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  40 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  42.03 
 
 		 792 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 78 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 816 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  38.71 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  43.28 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  38.71 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0080  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 837 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0334  heavy metal-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000340547  normal  0.151356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  38.71 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  38.71 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  38.71 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2131  cation-transporting ATPase  34.72 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  38.71 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 832 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  45 
 
 		 1182 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1095  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 759 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 759 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 841 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 		 793 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 801 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  38.71 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  40.58 
 
 		 792 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  38.71 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  31.94 
 
 		 797 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  38.71 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>