49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0373 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  100 
 
 		 459 aa  919    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  97.17 
 
 		 459 aa  896    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 454 aa  282  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  30.1 
 
 		 422 aa  169  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 453 aa  128  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 504 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 446 aa  96.7  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  21.07 
 
 		 513 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 531 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  26.83 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  20.79 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  26.8 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  22.19 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  23.26 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  23.24 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  23.95 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  23.34 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  24.11 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  23.39 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 469 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  24 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  22.64 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 402 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  22.12 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0799  hypothetical protein  21.52 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  20.54 
 
 		 408 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 482 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 415 aa  43.5  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>