186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3846 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  100 
 
 		 351 aa  716    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  42.8 
 
 		 477 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 436 aa  166  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  42.94 
 
 		 442 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  42.94 
 
 		 442 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  41.99 
 
 		 396 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  41.53 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  43.02 
 
 		 646 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  39.69 
 
 		 1635 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  42.37 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  39.52 
 
 		 373 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  37.17 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  31.49 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1085 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  32.1 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  34.87 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 995 aa  70.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.15 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  34.84 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  34.84 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  28.99 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 208 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.97 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  29.85 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 551 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  29.94 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  39 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  31.37 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 185 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.7 
 
 		 229 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  24.39 
 
 		 233 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  30.94 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 264 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 197 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 		 229 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 204 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 259 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 266 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 242 aa  49.7  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  33 
 
 		 201 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  33 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  33 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 248 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  33 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  23.08 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  33 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  33 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 210 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 197 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  24.58 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.19 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  31.96 
 
 		 201 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  41.07 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1253  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.75 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.087118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 296 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  23.19 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 		 488 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  23.19 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 261 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 257 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 1106 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  27.46 
 
 		 241 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.25 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3574  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  28.67 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  31.51 
 
 		 249 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.3 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 267 aa  46.2  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  26.63 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  20.18 
 
 		 235 aa  46.2  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 266 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1875  hypothetical protein  25.19 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1729  hypothetical protein  25.95 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  28.31 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0374  hypothetical protein  25.19 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0280  hypothetical protein  25.95 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2150  hypothetical protein  25.95 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>