More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1560 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1560  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 210 aa  438  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25247  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  67 
 
 		 211 aa  289  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2869  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.55 
 
 		 213 aa  287  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491062  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2973  glutathione S-transferase-like  59.2 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00286843  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  49.51 
 
 		 209 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3742  glutathione S-transferase family protein  48.06 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2207  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.54 
 
 		 209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.57 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0144  glutathione S-transferase  45.54 
 
 		 230 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2712  glutathione S-transferase-like  32.02 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  33.5 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  32.49 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4748  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  34.01 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  33.18 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  32.32 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  34.65 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.99 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.49 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  32 
 
 		 200 aa  92  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  33.83 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.51 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  32.47 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  31.31 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  32.49 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.51 
 
 		 198 aa  91.3  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  31.98 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.55 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.96 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  32.32 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  30.3 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  32.08 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.65 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4773  glutathione S-transferase-like  30.05 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.44 
 
 		 200 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  31.68 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.59 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  33.65 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.29 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  30.96 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  32.55 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  27.92 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  32.34 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 266 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 297 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 300 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  30.96 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  34.31 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  29.7 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  29.95 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  31.86 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  33.66 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  28.93 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.12 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  31.31 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  31.47 
 
 		 226 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  30.84 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.66 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  31.66 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  28.36 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  28.93 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  31 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  30.96 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  29.84 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  28.92 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  27.88 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.85 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  31.03 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  33.16 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  28.5 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  30.85 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  31.46 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  30.46 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  30.35 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  29.29 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  31.63 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.3 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2975  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.72 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5332  Glutathione S-transferase domain  27.09 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.59 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.65 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.59 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1633  Glutathione S-transferase domain protein  29.02 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0604815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  29.59 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  28.57 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>