190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1262 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  100 
 
 		 346 aa  695    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2604  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  71.43 
 
 		 347 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4330  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  73.98 
 
 		 342 aa  501  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0632044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1262  ABC phosphate transporter, periplasmic phosphate-binding protein  71.72 
 
 		 347 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1533  periplasmic binding protein  73.39 
 
 		 341 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2289  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  68.5 
 
 		 344 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.789525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1919  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  69.97 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141978  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_004310  BR2138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  64.39 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0771  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  64.69 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2053  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  64.09 
 
 		 348 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0119  putative phosphate-binding periplasmic protein  64.07 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0168  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  65.8 
 
 		 344 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0178  phosphate ABC transporter, substrate-binding protein  66.12 
 
 		 344 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433451  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0495  ABC transporter substrate binding protein (phosphate)  60.76 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135547  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1228  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  55.87 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.458915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3121  phosphate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  56.56 
 
 		 346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355955  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1476  periplasmic phosphate binding protein  42.07 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0598  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  42.27 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0165881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3629  phosphate ABC transporter periplasmic binding protein  42.5 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0464  periplasmic phosphate binding protein  41.34 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.707597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0394  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  42.24 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1230  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  42.06 
 
 		 408 aa  249  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3755  phosphate binding protein, putative  40.68 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.58233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0949  phosphate binding protein, putative  41.03 
 
 		 351 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2409  ABC phosphate transporter eriplasmic phosphate-binding protein  41.12 
 
 		 350 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0315618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2679  periplasmic phosphate binding protein  39.47 
 
 		 338 aa  242  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1544  phosphate binding protein, putative  41.88 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3318  phosphate binding protein, putative  38.17 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1784  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  40.06 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0376  periplasmic phosphate binding protein  39.82 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1859  periplasmic phosphate binding protein  38.78 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.266184  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0378  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  37.01 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.686429  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0501  periplasmic phosphate binding protein  38.87 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4242  putative phosphate-binding periplasmic protein  38.44 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.391821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2276  phosphate binding protein, putative  37.8 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0716872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0396  phosphate ABC transporter, periplasmic binding protein  37.66 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.883019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0263  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS, putative  39.38 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0826  phosphate binding protein, putative  38.7 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320432  normal  0.0147746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2565  periplasmic phosphate binding protein  39.75 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0150  phosphate ABC transporter, periplasmicphosphate-binding protein, putative  35 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0122043  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3102  phosphate binding protein, putative  35.33 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0457162  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0977  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.83 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0063  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  36 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1056  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.43 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.929077  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2035  phosphate binding protein, putative  34.43 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0642  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  33.13 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0716  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  32.23 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0801  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.35 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  32.5 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  30.2 
 
 		 651 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  30.69 
 
 		 666 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  31.08 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.57 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  29.19 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.41 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  27.98 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  28.39 
 
 		 669 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  29.11 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4080  phosphate binding protein  30.93 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3334  phosphate binding protein  27.36 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  26.49 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  26.49 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  27.72 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  27.72 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4067  phosphate binding protein  25.48 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4106  phosphate binding protein  25.48 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2488  phosphate binding protein  29.28 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2444  phosphate binding protein  27.36 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.988247  hitchhiker  0.00654612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0045  phosphate binding protein  24.71 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8362  normal  0.817382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  30.61 
 
 		 333 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  28.18 
 
 		 692 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  28.89 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3298  phosphate binding protein  27.35 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0670  phosphate binding protein  28.8 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  29.84 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3610  phosphate binding protein  26.78 
 
 		 376 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  28.89 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2825  phosphate binding protein  27.35 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.820389  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.9 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.38 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  27.43 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  29.55 
 
 		 338 aa  93.2  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4174  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.07 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4496  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.07 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4012  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.07 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3716  phosphate binding protein  27.92 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.583691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4292  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.07 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000804366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3000  phosphate binding protein  26.2 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4022  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.77 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  25.15 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0330  phosphate binding protein  28.18 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0209981  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4352  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.7 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4300  phosphate binding protein  25.34 
 
 		 369 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0286  phosphate binding protein  28.52 
 
 		 315 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0495  phosphate binding protein  27.74 
 
 		 361 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.853772  hitchhiker  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  29.04 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4077  phosphate binding protein  25.39 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.844211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2478  phosphate binding protein  27.15 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  28.47 
 
 		 338 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>