More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1482 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
337 aa  684    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  66.03 
 
 
317 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  61.17 
 
 
319 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  62.5 
 
 
312 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  55.95 
 
 
313 aa  349  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  55.59 
 
 
310 aa  342  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  53.21 
 
 
320 aa  333  3e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  53.21 
 
 
320 aa  333  3e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.21 
 
 
310 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  55.41 
 
 
322 aa  325  7e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  56.96 
 
 
316 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  54.1 
 
 
314 aa  322  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  52.27 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  51.63 
 
 
327 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  52 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  50.48 
 
 
649 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  45.05 
 
 
331 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  43.54 
 
 
346 aa  249  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  40.5 
 
 
326 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  49.63 
 
 
347 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  48.73 
 
 
326 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  41.4 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  39.38 
 
 
320 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  38.98 
 
 
355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  40.13 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  40.76 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  44.49 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  38.87 
 
 
353 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  36.87 
 
 
344 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 
353 aa  205  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  39.36 
 
 
359 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  44.08 
 
 
313 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  44.08 
 
 
313 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.74 
 
 
345 aa  202  9e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  38.29 
 
 
354 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
359 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  38.36 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  38.36 
 
 
340 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  35.31 
 
 
356 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  35.31 
 
 
356 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  34.82 
 
 
320 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  37.58 
 
 
335 aa  193  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  35.96 
 
 
360 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.99 
 
 
352 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  35.92 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  36.19 
 
 
340 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  37.74 
 
 
340 aa  188  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  39.21 
 
 
327 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  35.56 
 
 
340 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  36.34 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  34.91 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  34.8 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  38.56 
 
 
327 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  35.35 
 
 
334 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  34.71 
 
 
334 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  36.42 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  34.28 
 
 
334 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  35.94 
 
 
323 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  37.46 
 
 
344 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  36.56 
 
 
361 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  37.15 
 
 
309 aa  165  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  34.46 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  32.47 
 
 
313 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  32.48 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 
317 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  38.81 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  37.37 
 
 
320 aa  146  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 
331 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  33.54 
 
 
334 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  34.29 
 
 
332 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  36.03 
 
 
306 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  37.9 
 
 
361 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  33.44 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.87 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  31.79 
 
 
310 aa  135  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  33.33 
 
 
334 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  33.01 
 
 
345 aa  132  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  32.57 
 
 
335 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 
307 aa  132  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  33.77 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  33.68 
 
 
305 aa  125  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  35.98 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  29.61 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
350 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 
318 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 
350 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  27.81 
 
 
335 aa  105  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.07 
 
 
317 aa  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  36.6 
 
 
328 aa  103  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 
310 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
311 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 
350 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.8 
 
 
332 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  33.9 
 
 
338 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.8 
 
 
318 aa  99.8  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  30.55 
 
 
334 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 
333 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>