73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0116 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  30.69 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0285  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  27.08 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0371568  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3677  high-affinity nickel-transporter  29.19 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.841534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  26.99 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  25.3 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2976  high-affinity nickel-transporter  23.6 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  27 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1079  permease  26.12 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0887396  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  27.17 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  24.6 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  26.5 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  26.5 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  26.5 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  26.84 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  26.07 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3031  high-affinity nickel-transporter  24.79 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  25.11 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  25.11 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  25.11 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  21.79 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3041  high-affinity nickel-transporter  23 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.167253  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1234  high-affinity nickel-transporter  22.88 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2245  high-affinity nickel-transporter  25.81 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0942  high-affinity nickel-transporter  29.71 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0338054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  25 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  33.7 
 
 		 390 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  29.94 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  24.6 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3208  high-affinity nickel-transporter  27.39 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  29.91 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0391  high-affinity nickel-transporter  25.58 
 
 		 342 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  21.1 
 
 		 345 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0081  high-affinity nickel-transporter  32.11 
 
 		 383 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.940198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  32.61 
 
 		 398 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  24.34 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0096  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  25.94 
 
 		 505 aa  49.3  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00355357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3811  hypothetical protein  27.69 
 
 		 389 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0277  high-affinity nickel-transporter  24.6 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  33.88 
 
 		 358 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  25.64 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1678  high-affinity nickel-transporter  23.25 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0510109  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1782  high-affinity nickel-transporter  25.6 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1398  high-affinity nickel-transporter  24.32 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0677472  normal  0.0633291 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4249  high-affinity nickel-transporter  27.49 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  25 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0096  hypothetical protein  27.52 
 
 		 367 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0860  high-affinity nickel-transporter  30.43 
 
 		 389 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1403  high-affinity nickel-transporter  24.47 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198577  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0088  hypothetical protein  27.52 
 
 		 360 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  38.98 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3692  high-affinity nickel-transporter  36.73 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  34.18 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  26.67 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  32.5 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  28.57 
 
 		 513 aa  43.9  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1976  putative nickel transporter  36.99 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  38.78 
 
 		 376 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  22.11 
 
 		 447 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  40.82 
 
 		 377 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  33.33 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  30.88 
 
 		 179 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.88 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  30.88 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  38.78 
 
 		 353 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.88 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.88 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  38.78 
 
 		 390 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  38.78 
 
 		 371 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1353  putative high affinity nickel transporter  30.95 
 
 		 406 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.85251  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  33.82 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  31.82 
 
 		 377 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>