62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1403 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1403  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 337 aa  616  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198577  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1678  high-affinity nickel-transporter  97.33 
 
 		 337 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0510109  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1398  high-affinity nickel-transporter  90.5 
 
 		 337 aa  494  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0677472  normal  0.0633291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2245  high-affinity nickel-transporter  70.3 
 
 		 330 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0277  high-affinity nickel-transporter  67.35 
 
 		 337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2333  high-affinity nickel-transporter  69.07 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144614  normal  0.152273 
 
 
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NC_010581  Bind_0081  high-affinity nickel-transporter  37.77 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.940198 
 
 
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NC_011666  Msil_1782  high-affinity nickel-transporter  46.01 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_0391  high-affinity nickel-transporter  42.91 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  39.49 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  37.41 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4249  high-affinity nickel-transporter  32.75 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  37.04 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  39.5 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  39.5 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  39.15 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  39.15 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  38.79 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3692  high-affinity nickel-transporter  36.59 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_2905  high-affinity nickel-transporter  37.73 
 
 		 381 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
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NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  36.52 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  35.94 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  36.27 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_3031  high-affinity nickel-transporter  36.5 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0860  high-affinity nickel-transporter  49.44 
 
 		 389 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.474349 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2976  high-affinity nickel-transporter  39.31 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3811  hypothetical protein  34.58 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  50 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_1353  putative high affinity nickel transporter  50.68 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.85251  normal  0.315811 
 
 
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NC_011004  Rpal_0942  high-affinity nickel-transporter  50.68 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0338054  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  34.69 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  34.69 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
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NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  34.69 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  49.32 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
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NC_007963  Csal_3208  high-affinity nickel-transporter  41.42 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1234  high-affinity nickel-transporter  30.42 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3041  high-affinity nickel-transporter  31.18 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.167253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  39.7 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  34.54 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  36.4 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  29.7 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
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NC_009504  BOV_A0088  hypothetical protein  39.35 
 
 		 360 aa  93.2  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1079  permease  27.17 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0887396  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA0096  hypothetical protein  39.35 
 
 		 367 aa  93.2  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I1976  putative nickel transporter  28.7 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A1753  high-affinity nickel-transporter  42.13 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_1929  high-affinity nickel-transporter  36.06 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
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NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  29.1 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_0753  high-affinity nickel-transporter  31.65 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000315045  normal  0.331019 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  32.32 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1737  high-affinity nickel-transporter  42.86 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284781  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_0285  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  29.03 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0371568  n/a   
 
 
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NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  27.43 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
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NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  24.56 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
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NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  23.47 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  28.8 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
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NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  24.27 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
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NC_008607  Ppro_3677  high-affinity nickel-transporter  23.08 
 
 		 207 aa  49.7  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.841534  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  24.51 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
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NC_009802  CCC13826_1792  tRNA pseudouridine synthase B  23.98 
 
 		 497 aa  47  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  21.98 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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