115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0907 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0907  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 98 aa  190  7e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  44.16 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  47.44 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  43.84 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  40.24 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  43.84 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  40.26 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  39.73 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  37.66 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  35 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  36.84 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  35 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  36.84 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  35 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  35.96 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  39.13 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  36 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  37.66 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  35.82 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  32.89 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  34.15 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  34.15 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  37.84 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  35.82 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  35.14 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  40.54 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  35.94 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  35.82 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1454  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  35 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  35.06 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  36 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  33.73 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  35.82 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  36.99 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  33.77 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  34.48 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  32.47 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  32.47 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  32.47 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  32.47 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0859  30S ribosomal protein S20  32.05 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000132311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0646  ribosomal protein S20  45.9 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  36.11 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2122  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00639471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  35.82 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  33.78 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  35.82 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  35.82 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  36.11 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  36.11 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3570  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  34.25 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1167  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 99 aa  42  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1777  30S ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  32.47 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  31.17 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  34.72 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  32.47 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  36 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  32.47 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  32.47 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  32.47 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  33.73 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  32.88 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  34.62 
 
 		 91 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1288  30S ribosomal protein S20  35.06 
 
 		 88 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000699661  normal  0.326601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  34.72 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  34.72 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  34.72 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  34.72 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  34.72 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  32.05 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  33.77 
 
 		 88 aa  40.8  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  31.34 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  35.14 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  35.14 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  32.05 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  34.33 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2726  30S ribosomal protein S20  35.62 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000316732  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  32.05 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>