More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0815 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0815  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
221 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000249143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 
210 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  45.45 
 
 
206 aa  181  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 
210 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  44.13 
 
 
212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  45.02 
 
 
209 aa  175  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0323  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 
214 aa  174  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000334047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 
211 aa  174  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  46.38 
 
 
209 aa  174  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  44.34 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  45.02 
 
 
209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  49.76 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  45.02 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  43.78 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
210 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
210 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  46.23 
 
 
216 aa  171  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  45.02 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 
210 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  46.31 
 
 
209 aa  171  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  43.32 
 
 
219 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 
212 aa  170  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000266431  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 
208 aa  170  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0767  50S ribosomal protein L3  44.39 
 
 
208 aa  169  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
210 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
210 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
210 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
210 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
210 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 
212 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000715109  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
210 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
210 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  43.4 
 
 
209 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  42.92 
 
 
209 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
210 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  44.55 
 
 
214 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  42.92 
 
 
211 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  43.6 
 
 
212 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  43.58 
 
 
211 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  42.18 
 
 
212 aa  168  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  44.34 
 
 
212 aa  168  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0265  50S ribosomal protein L3  41.51 
 
 
232 aa  168  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 
209 aa  168  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  43.58 
 
 
211 aa  168  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  44.55 
 
 
209 aa  168  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  43.4 
 
 
212 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  43.58 
 
 
211 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  41.51 
 
 
210 aa  168  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 
209 aa  168  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 
209 aa  167  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 
209 aa  167  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 
209 aa  167  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  42.18 
 
 
212 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0231  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
212 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3759  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
212 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000358076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 
209 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0199  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
212 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000636858  unclonable  0.0000000000196513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0194  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
212 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000648086  decreased coverage  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0199  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
212 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000010724  hitchhiker  0.0000000019855 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  43.54 
 
 
206 aa  167  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  42.2 
 
 
211 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  40.76 
 
 
207 aa  166  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 
210 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  42.2 
 
 
211 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16240  LSU ribosomal protein L3P  48.34 
 
 
206 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0560879  hitchhiker  0.00000737829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  42.18 
 
 
210 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 
211 aa  165  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  45.02 
 
 
209 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  43.6 
 
 
212 aa  165  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  44.34 
 
 
205 aa  165  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  42.92 
 
 
218 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0196  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4056  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139517  hitchhiker  0.00000000018898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4170  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0200  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000546138  unclonable  0.00000936811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0148  50S ribosomal protein L3  42.18 
 
 
212 aa  164  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000284118  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  41.51 
 
 
216 aa  164  9e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0213  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 
212 aa  164  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000046877  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  44.08 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  42.18 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3644  50S ribosomal protein L3  42.38 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000185363  hitchhiker  0.0000000000200291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0314  50S ribosomal protein L3  42.38 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138197  hitchhiker  0.00855725 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  42.38 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  40.09 
 
 
219 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  41.23 
 
 
211 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  43.13 
 
 
209 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  44.81 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  43.4 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>