More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0701 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0701  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
107 aa  216  1e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.763795  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  92  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  47.47 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  42.72 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 
103 aa  87.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  42.42 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.44 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  39.81 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  46.74 
 
 
171 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  42 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  46 
 
 
100 aa  84  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  41.75 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  45.45 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  42.16 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  37.86 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  40.2 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  38.83 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  36.54 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  45.1 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  43.62 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  44.44 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  39.39 
 
 
103 aa  77  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  40.4 
 
 
103 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  44.76 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  36.54 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  43.43 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>