224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0483 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  37.57 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  36.96 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  36.67 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  37.57 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  36.11 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  36.67 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  38.5 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  34.03 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  35 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  35.48 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  32.62 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  32.45 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  32.95 
 
 		 187 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  31.36 
 
 		 208 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  31.14 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  31.55 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  31.46 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  30.98 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48166  predicted protein  29.53 
 
 		 393 aa  91.3  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118816  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  31.03 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  31.03 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  29.89 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  30.51 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  29.41 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  30.46 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  30.51 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  30.51 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  30.51 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  29.41 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  30.51 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  30.51 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  30.51 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  28.57 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  30.64 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  30.64 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  30.64 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  29.94 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  30.94 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  29.94 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  29.94 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  29.94 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  29.94 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  29.34 
 
 		 195 aa  87.8  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  31.79 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  31.79 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  31.79 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  30.18 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  29.94 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  29.71 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  30.18 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  29.94 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  31.79 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  30.64 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  28.14 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  29.48 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  32.14 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  30.86 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  31.55 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  29.28 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  32.14 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  32.14 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  28.42 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  30.05 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  30.46 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  30.64 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  27.68 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  28.74 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  29.94 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  31.91 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  32.12 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  29.44 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  29.59 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  28.32 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  29.28 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  30.37 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  30.9 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  28.57 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2895  protein of unknown function DUF179  30.95 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0104323  normal  0.0123149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  31.09 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  28.42 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  28.16 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  29.09 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88895  predicted protein  34.41 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0380911  hitchhiker  0.00603627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  28.65 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  29.41 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  32.09 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  27.07 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  29.51 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  28.4 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  30.77 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  25.88 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>