More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13548 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5009  acyl-CoA synthetase  79.12 
 
 		 549 aa  902    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5215  acyl-CoA synthetase  84.43 
 
 		 549 aa  957    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13548  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 548 aa  1120    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.89294e-46  hitchhiker  0.000000367112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1543  acyl-CoA synthetase  84.25 
 
 		 549 aa  951    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4627  acyl-CoA synthetase  79.67 
 
 		 549 aa  909    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4715  acyl-CoA synthetase  79.67 
 
 		 549 aa  909    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3959  AMP-dependent synthetase and ligase  56.19 
 
 		 547 aa  629  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2836  acyl-CoA synthetase  53.52 
 
 		 539 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2639  acyl-CoA synthetase  53.51 
 
 		 540 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.981359  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2725  acyl-CoA synthetase  51.41 
 
 		 548 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1485  CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  48.87 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3980  AMP-dependent synthetase and ligase  46.2 
 
 		 526 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  46.08 
 
 		 540 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4748  AMP-dependent synthetase and ligase  45.2 
 
 		 528 aa  425  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3496  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 544 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38244  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0888  AMP-dependent synthetase and ligase  42.67 
 
 		 545 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1786  acyl-CoA synthetase  40.84 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1833  acyl-CoA synthetase  40.84 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1767  acyl-CoA synthetase  41.13 
 
 		 549 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.848326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 545 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.172383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2010  acyl-CoA synthetase  40.42 
 
 		 550 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4335  acyl-CoA synthetase  40.15 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0901424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2248  acyl-CoA synthetase  41.57 
 
 		 550 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 557 aa  346  6e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13546  fatty-acid-CoA ligase fadD18  98.81 
 
 		 218 aa  345  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.46199e-133  hitchhiker  0.000000428617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  39.59 
 
 		 536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  38.88 
 
 		 536 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2921  acyl-CoA synthetase  37.75 
 
 		 558 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2891  acyl-CoA synthetase  37.75 
 
 		 558 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2935  acyl-CoA synthetase  37.75 
 
 		 558 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  38.43 
 
 		 536 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0691  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 553 aa  297  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 605 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1756  acyl-CoA synthetase  36.45 
 
 		 542 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1775  acyl-CoA synthetase  36.63 
 
 		 542 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1822  acyl-CoA synthetase  36.63 
 
 		 542 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1995  acyl-CoA synthetase  36.08 
 
 		 541 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4349  acyl-CoA synthetase  36.47 
 
 		 541 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1563  acyl-CoA synthetase  35.21 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1531  acyl-CoA synthetase  33.77 
 
 		 531 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 528 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 525 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1806  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 526 aa  196  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3124  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 		 545 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 516 aa  196  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 		 662 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  31.3 
 
 		 516 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 511 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 		 526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 520 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 501 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 551 aa  181  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 515 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  26.47 
 
 		 608 aa  180  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.47643  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 501 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 501 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.19 
 
 		 565 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 862 aa  179  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  29.92 
 
 		 516 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 511 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1180  hypothetical protein  26.41 
 
 		 544 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  31.13 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 530 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 526 aa  176  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.18 
 
 		 525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.08 
 
 		 525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  29.77 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.39 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  29.47 
 
 		 538 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 509 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 		 515 aa  173  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.21 
 
 		 524 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  30.93 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 		 559 aa  172  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  29.57 
 
 		 487 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.26 
 
 		 519 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  29.11 
 
 		 538 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 561 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 520 aa  171  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 587 aa  169  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 521 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 577 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 535 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0351635  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 		 518 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 539 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.05 
 
 		 526 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  26.18 
 
 		 523 aa  167  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 		 524 aa  167  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  27.62 
 
 		 549 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 515 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 515 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>