More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11465 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11465  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
412 aa  813    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0038039  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  79.16 
 
 
402 aa  626  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  77.34 
 
 
407 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2445  phosphoglycerate kinase  75.56 
 
 
407 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.637803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2405  phosphoglycerate kinase  75.56 
 
 
407 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2451  phosphoglycerate kinase  75.56 
 
 
407 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  70.1 
 
 
412 aa  560  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2364  Phosphoglycerate kinase  72.03 
 
 
403 aa  554  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  62.07 
 
 
402 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2801  Phosphoglycerate kinase  60.05 
 
 
398 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000278767  hitchhiker  0.000011346 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  60.4 
 
 
399 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  60.5 
 
 
397 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11360  phosphoglycerate kinase  56.17 
 
 
415 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.430751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  61.54 
 
 
399 aa  431  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  57.92 
 
 
399 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  59.23 
 
 
399 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5198  Phosphoglycerate kinase  57.88 
 
 
388 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  58.52 
 
 
398 aa  419  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2088  phosphoglycerate kinase  56.07 
 
 
408 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.283542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 
395 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1829  phosphoglycerate kinase  55.93 
 
 
408 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192854 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  56.44 
 
 
401 aa  413  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  59.16 
 
 
399 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  56.93 
 
 
401 aa  410  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  58.17 
 
 
399 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  56.74 
 
 
395 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  57.65 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 
394 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  58.84 
 
 
400 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1942  Phosphoglycerate kinase  57.78 
 
 
395 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.797468  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 
395 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  58.27 
 
 
395 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1549  Phosphoglycerate kinase  58.01 
 
 
405 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2531  phosphoglycerate kinase  57.58 
 
 
399 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  53.03 
 
 
400 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2064  phosphoglycerate kinase  55.3 
 
 
400 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.56 
 
 
687 aa  376  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2930  Phosphoglycerate kinase  56.65 
 
 
412 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  48.15 
 
 
397 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.37 
 
 
646 aa  359  6e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.91 
 
 
650 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  46.31 
 
 
393 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  46.31 
 
 
402 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  46.31 
 
 
402 aa  344  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  48.59 
 
 
389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  45.29 
 
 
397 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  48.85 
 
 
398 aa  338  7e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  48.14 
 
 
399 aa  335  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  45.39 
 
 
397 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  48.97 
 
 
399 aa  334  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  46.31 
 
 
395 aa  333  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  44.47 
 
 
397 aa  333  4e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  47.8 
 
 
399 aa  333  5e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  45.32 
 
 
401 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  46.06 
 
 
401 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  45.32 
 
 
401 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  46.33 
 
 
394 aa  328  8e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  46.58 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  45.34 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  47.29 
 
 
392 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  46.31 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  44.33 
 
 
396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  44.58 
 
 
401 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  46.56 
 
 
396 aa  325  9e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  45.93 
 
 
394 aa  324  1e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  43.84 
 
 
401 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  45.01 
 
 
402 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  44.25 
 
 
402 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  45.94 
 
 
400 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  46.12 
 
 
435 aa  323  3e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  43.98 
 
 
400 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  43.98 
 
 
400 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  45.01 
 
 
402 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  43.6 
 
 
401 aa  322  6e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  46.06 
 
 
400 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  47.91 
 
 
392 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  45.39 
 
 
393 aa  319  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  45.8 
 
 
396 aa  318  7e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  45.01 
 
 
406 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0616  phosphoglycerate kinase  42.75 
 
 
399 aa  318  1e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.160418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  46.32 
 
 
393 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  45 
 
 
399 aa  317  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 
388 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  45.78 
 
 
400 aa  317  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.39 
 
 
655 aa  317  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  41.98 
 
 
393 aa  316  4e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  46.93 
 
 
395 aa  316  6e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  44.28 
 
 
402 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  47.04 
 
 
395 aa  315  8e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  44.29 
 
 
403 aa  315  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  42.64 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  44.16 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  42.79 
 
 
394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  44.42 
 
 
394 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1428  phosphoglycerate kinase  44.61 
 
 
401 aa  311  1e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  44.19 
 
 
396 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  44.19 
 
 
396 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  42.23 
 
 
443 aa  310  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  42.29 
 
 
394 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  42.04 
 
 
394 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>