40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2528 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  42.13 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  41.7 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  41.23 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  55.65 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  60.19 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  58.25 
 
 		 211 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  36.62 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  49.09 
 
 		 149 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  45.45 
 
 		 174 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.36 
 
 		 699 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  36.43 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  42.73 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  42.73 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  43.86 
 
 		 165 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4313  NC domain-containing protein  37.76 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  41.82 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.64 
 
 		 702 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  37.4 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  37.1 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  35.11 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  43.24 
 
 		 153 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  39.09 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  42.61 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  38.24 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  35.24 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  37.25 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  38.24 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  37.25 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  35.24 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1265  hypothetical protein  29.92 
 
 		 180 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00671  hypothetical protein  42.22 
 
 		 51 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  34.65 
 
 		 295 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  50 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  31.43 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  31.51 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  41.67 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  30.49 
 
 		 227 aa  42  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>