33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0063 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  70.95 
 
 
211 aa  312  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  56.44 
 
 
226 aa  235  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  59.43 
 
 
228 aa  145  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  50.44 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  37.2 
 
 
225 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  37.2 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  44.68 
 
 
228 aa  94.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  45.45 
 
 
149 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  44.35 
 
 
154 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  41.53 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  38.13 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  42.48 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  34.03 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  43.88 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  43.88 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  43.36 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  40.98 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  41.05 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.03 
 
 
699 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  41.18 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.62 
 
 
702 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4313  NC domain-containing protein  37.27 
 
 
174 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  39.22 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00671  hypothetical protein  56.52 
 
 
51 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  35.87 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  35.42 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  35.87 
 
 
240 aa  55.1  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  35.42 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  32.06 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  32.38 
 
 
241 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1526  hypothetical protein  31.58 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>