36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0479 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  345  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  92.22 
 
 		 165 aa  314  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  69.18 
 
 		 176 aa  218  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  61.49 
 
 		 178 aa  173  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  58.73 
 
 		 699 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  53.9 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  55.4 
 
 		 159 aa  160  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  52.35 
 
 		 166 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  52.35 
 
 		 166 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  54.76 
 
 		 207 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  55.73 
 
 		 702 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  54.33 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  51.01 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  39.1 
 
 		 240 aa  98.6  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  42.99 
 
 		 240 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  44.9 
 
 		 226 aa  84  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  40.43 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  41.12 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  42.06 
 
 		 240 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  46 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  43.93 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  41.12 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  41.82 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  42.86 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  38.32 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  37.68 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  37.68 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  38.13 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  37.9 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  41.12 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4313  NC domain-containing protein  34.58 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0385  hypothetical protein  29.69 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632262 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001840  hypothetical protein  34.88 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0006  hypothetical protein  29.9 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4581  hypothetical protein  32.63 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0874  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00470179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>