37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1693 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  100 
 
 		 240 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  93.33 
 
 		 240 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  92.5 
 
 		 240 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  90 
 
 		 240 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  89.58 
 
 		 240 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  52.08 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  41.12 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  42.06 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  42.98 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  38.6 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  39.25 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  39.25 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  35.82 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  38.05 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.06 
 
 		 699 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  39.8 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  37.9 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  43.93 
 
 		 178 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  36.63 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.24 
 
 		 702 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  38.24 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  33.96 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  33.96 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0385  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632262 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  34 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  35.87 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  35.42 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  33 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  34.07 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4313  NC domain-containing protein  31.51 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1265  hypothetical protein  32.58 
 
 		 180 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1699  hypothetical protein  25.27 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 473 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0874  hypothetical protein  28.28 
 
 		 159 aa  42.7  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00470179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0006  hypothetical protein  26.6 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>