36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2422 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  61.49 
 
 
167 aa  184  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  59.86 
 
 
165 aa  177  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  56.94 
 
 
176 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.9 
 
 
699 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  55.15 
 
 
187 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  54.48 
 
 
166 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  54.48 
 
 
166 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  55.65 
 
 
154 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  63.3 
 
 
207 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  52.82 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.94 
 
 
702 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  49.65 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  36.84 
 
 
240 aa  88.6  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  43.16 
 
 
228 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  42.06 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  43.93 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  40 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  43.16 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  43.93 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  43.93 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  39.39 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  39.39 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  41.18 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  41.12 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  41.07 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  42.11 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  41.12 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  39.47 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  34.55 
 
 
174 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0385  hypothetical protein  30.25 
 
 
155 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000632262 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0006  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1699  hypothetical protein  31.18 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4581  hypothetical protein  30.85 
 
 
196 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4313  NC domain-containing protein  30.91 
 
 
174 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1265  hypothetical protein  36.84 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.117766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>