36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4383 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 166 aa  343  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  343  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  55.56 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  52.35 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  53.47 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  51.68 
 
 		 165 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  53.73 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  55.65 
 
 		 699 aa  151  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.82 
 
 		 702 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  50.38 
 
 		 154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  48.89 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  54.48 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  51.35 
 
 		 207 aa  131  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  36.5 
 
 		 240 aa  99  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  42.73 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  45.45 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  39.67 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  45.26 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  40.91 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  46.53 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  40.19 
 
 		 240 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  39.25 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  39.25 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  43.88 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  38.38 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  38.38 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  40.19 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  38.32 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  38.05 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  35.51 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0006  hypothetical protein  36 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0385  hypothetical protein  27.34 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0874  hypothetical protein  28.7 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00470179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4313  NC domain-containing protein  31.48 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4581  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001840  hypothetical protein  33.71 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>