25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1526 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1526  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2854  hypothetical protein  55.44 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1586  hypothetical protein  54.45 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.196957  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1580  hypothetical protein  54.92 
 
 		 199 aa  228  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.530554  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1519  hypothetical protein  53.93 
 
 		 199 aa  227  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000380714  normal  0.0491707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2670  hypothetical protein  52.53 
 
 		 198 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2635  hypothetical protein  53.03 
 
 		 198 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.895876  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2749  hypothetical protein  52.53 
 
 		 198 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188485  normal  0.0271892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2832  hypothetical protein  51.3 
 
 		 194 aa  223  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830995 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2367  hypothetical protein  54.4 
 
 		 196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406853  normal  0.0535079 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1714  hypothetical protein  52.02 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0456721  hitchhiker  0.000000514861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1755  hypothetical protein  50.52 
 
 		 192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.196459  normal  0.218269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1699  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  204  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0006  hypothetical protein  33.57 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4581  hypothetical protein  36.84 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0874  hypothetical protein  34.29 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00470179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001840  hypothetical protein  36.25 
 
 		 115 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  28.43 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  27.45 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  27.45 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  31.58 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  31.58 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  27.45 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  27.45 
 
 		 240 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>