34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1253 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  494  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  52.5 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  52.08 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  51.25 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  52.08 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  51.25 
 
 		 240 aa  231  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  40.19 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  40.19 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  38.61 
 
 		 228 aa  72  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  39.25 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  41.12 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  40.19 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  42.06 
 
 		 165 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  38.32 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  39.25 
 
 		 176 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  31.65 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  39.66 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.29 
 
 		 702 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  35.24 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.17 
 
 		 699 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  32.33 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  35.16 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  41.12 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  30.08 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  30.08 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  33.71 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  34.38 
 
 		 149 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  32.38 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0385  hypothetical protein  32.17 
 
 		 155 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1265  hypothetical protein  32.22 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4581  hypothetical protein  31.11 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1280  hypothetical protein  29.5 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342699  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  34.55 
 
 		 174 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>