32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3774 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  470  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  99.56 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  66.96 
 
 
226 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  48.46 
 
 
228 aa  228  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  40.43 
 
 
228 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  38.06 
 
 
149 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  37.2 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  43.36 
 
 
211 aa  98.2  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  41.59 
 
 
226 aa  98.2  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  36.36 
 
 
174 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  37.04 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  26.81 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  37.68 
 
 
167 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.16 
 
 
699 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.2 
 
 
702 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  41.41 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  41.18 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  38.38 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  38.38 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  39.39 
 
 
176 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4313  NC domain-containing protein  34.27 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  36.27 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  39.39 
 
 
178 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  37.37 
 
 
153 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  40.62 
 
 
159 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  33.96 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  33.68 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  33.02 
 
 
240 aa  55.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  30.08 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  32.08 
 
 
240 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  33.02 
 
 
240 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  36.51 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>