26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0385 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0385  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000632262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1261  hypothetical protein  57.81 
 
 
72 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1265  hypothetical protein  31.58 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1280  hypothetical protein  33.57 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342699  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  36.61 
 
 
240 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  34.82 
 
 
240 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  35.71 
 
 
240 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
240 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  32.14 
 
 
240 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0874  hypothetical protein  31.82 
 
 
159 aa  53.9  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00470179  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  29.69 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  29.69 
 
 
167 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  30.09 
 
 
207 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  27.14 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  27.34 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  27.34 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  30.19 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  32.17 
 
 
241 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  25.42 
 
 
187 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  27.54 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  26.61 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  30.25 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  29.79 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.36 
 
 
699 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0006  hypothetical protein  30 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  31.45 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>