33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1046 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  100 
 
 
240 aa  489  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  35.2 
 
 
187 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  38.93 
 
 
176 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  36.5 
 
 
166 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  36.5 
 
 
166 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  39.1 
 
 
167 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.06 
 
 
699 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  39.1 
 
 
165 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  37.31 
 
 
207 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  36.23 
 
 
153 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  37.86 
 
 
159 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  31.55 
 
 
211 aa  88.6  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  29.21 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.83 
 
 
702 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  38.03 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  34.81 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  28.41 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  26.81 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  36.84 
 
 
178 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  26.38 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  34.78 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  31.3 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  35.11 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  35.07 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  35.82 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  34.03 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  33.58 
 
 
240 aa  72  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  32.09 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  32.09 
 
 
174 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  32.33 
 
 
241 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4313  NC domain-containing protein  28.36 
 
 
174 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0385  hypothetical protein  27.54 
 
 
155 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000632262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0874  hypothetical protein  28.97 
 
 
159 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00470179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>