34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00651 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_00651  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0059  hypothetical protein  57.78 
 
 
211 aa  256  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0063  hypothetical protein  56.44 
 
 
212 aa  247  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2528  hypothetical protein  61.17 
 
 
228 aa  149  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2236  NC domain protein  35.36 
 
 
226 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4214  hypothetical protein  32.93 
 
 
228 aa  99  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3825  hypothetical protein  41.59 
 
 
225 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3774  hypothetical protein  41.59 
 
 
225 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1231  hypothetical protein  46.9 
 
 
154 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00832087  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4647  NC domain-containing protein  46.22 
 
 
149 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1046  NC domain-containing protein  36.88 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0134514  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5550  hypothetical protein  39.67 
 
 
159 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.927914  normal  0.571004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.34 
 
 
699 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6171  hypothetical protein  38.52 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.862503  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5872  hypothetical protein  38.58 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.4 
 
 
702 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4383  hypothetical protein  38.66 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4515  putative cell wall-associated hydrolase  38.66 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104706  normal  0.503963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4375  hypothetical protein  37.27 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  hitchhiker  0.0000000327117 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3830  hypothetical protein  41.13 
 
 
176 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.738224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0479  hypothetical protein  37.9 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1819  hypothetical protein  41.51 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4006  hypothetical protein  37.9 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.848587  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00671  hypothetical protein  60.87 
 
 
51 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2422  hypothetical protein  37.89 
 
 
178 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1253  retinol acyltransferase domain-containing protein  35.16 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  26.73 
 
 
240 aa  55.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1770  retinol acyltransferase domain-containing protein  36.26 
 
 
240 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4313  NC domain-containing protein  32.43 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  36.26 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  34.07 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  34.07 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1265  hypothetical protein  29.01 
 
 
180 aa  45.1  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1526  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>